河海大学是实施国家“211工程”重点建设、国家优势学科创新平台建设、一流学科建设以及设立研究生院的高校,国家首批授权授予学士、硕士和博士学位的高校之一。水利工程、环境科学与工程2个学科入围一流学科建设名单。工程学、环境/生态学、计算机科学、材料科学、地球科学、农业科学、化学、社会科学总论、数学等9个学科进入ESI世界排名前1%，其中“工程学”进入ESI世界排名前1‰。在全国第四轮学科评估中，水利工程学科以优异成绩获评A+。土木工程和环境科学与工程2个学科位列A类，跻身全国前10%。马克思主义理论、管理科学与工程、工商管理3个学科获评B+，位列全国前20%。拥有1个一级学科国家重点学科（水利工程），7个二级学科国家重点学科，2个二级学科国家重点学科培育点，6个江苏高校优势学科建设工程三期项目立项学科，10个“十四五”江苏省重点学科。共有42个学位授权点，覆盖了哲学、经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、农学、管理学等9个学科门类。其中博士学位授权一级学科16个、博士专业学位授权点2个、硕士学位授权一级学科42个（含博士授权）。